Цистеамин хидрохлорид може да се използва при производството на козметика, фуражна добавка, противоязвено лекарство, може да се прилага и при производството на биохимичен реагент и сложен агент на тежки месни йони. Той може да реагира с ензима на човешкото тяло и да стабилизира неговата работа, когато съществува радиация, поради което може да се използва за лечение на радиационен синдром и отровата на тетраетил олово. Може да се направи на таблетки или инжекции.